HUS Acamedic - tietoturvallinen käyttöympäristö
Virtuaalinen ja skaalautuva käyttöympäristö HUS Acamedic täyttää toisiolain vaatimukset ja on oiva työkalu muun muassa terveydenhuollon datan tutkimiseen.
HUS Acamedic on tietoturvallinen, skaalautuva, virtuaalinen ja auditoitu toisiolain täyttävä käyttöympäristö. Se toimii julkisessa internetissä virtuaalisesti tarvittaessa ympäri maailman, joten se mahdollistaa myös maailmanlaajuisen tutkimuksen. Se on käytettävissä niin julkisella kuin yksityisellä sektorilla. HUS Acamedic täyttää Findatan määräykset, ja se on rekisteröity Valviran Toini-rekisteriin.
Ota HUS Acamedic käyttöön
HUSin tutkija saa Acamedic-käyttöympäristön käyttöönsä Tutkijan työpöydällä.
HUSin ulkopuolinen henkilö voi tilata Acamedicin tällä tilauslomakkeella.
HUSin data tilataan HUSin Tietopalvelulta Tietoportaalista. Tietopalvelu poimii datan tietopyynnön tai tutkimusluvan mukaan ja toimittaa sen HUS Acamedic -käyttöympäristöön.
Kun HUS Acamedic on valmistunut, ilmoitetaan tilaajalle käyttöympäristön valmistumisesta, sekä etenemisohjeet luvitusta ja käyttöympäristön käyttöönottoa varten.
Tietoa HUS Acamedic -käyttöympäristöstä
HUS Acamedicissa on tarjolla kolme virtuaalityöpöytää käyttöympäristön käyttämiseen: Microsoft Windowsin työpöytä, Linux Ubuntu ja HPC (high performance computing) Linuxin työpöytä. Virtuaalityöpöydät toimivat Citrixin kautta. Käyttöympäristöä ja käyttöympäristön luvituksia koskevissa asioissa voit olla yhteydessä acamedic@hus.fi.
HUS Acamedicissa voidaan käyttää dataa eri lähteistä. Sen käyttö ei siis rajoitu vain HUSin potilasrekisteriin, jos tietolupa mahdollistaa aineistojen tuonnin tai yhdistämisen. Datan tallennuskapasiteetti käyttöympäristössä on yleensä viisi teratavua. Tallennuskapasiteettia voidaan helposti kasvattaa sataan teratavuun. Myös suuremmat datamäärät ovat mahdollisia. Dataformaattina käyvät kaikki yleisimmät tallennusmuodot. HUSin tietopalvelu siirtää datat käyttöympäristöön. Omia työkaluja, ohjelmistoja ja lähdekoodeja voidaan tuoda käyttöympäristöön tietyin rajoittein ja niistä tulee sopia tapauskohtaisesti. Työkaluja, jotka rikkovat Findatan määräyksiä ja/tai toisiolakia ei voi tuoda käyttöympäristöön.
HUS Acamediciin on saatavilla laaja ohjelmistovalikoima. Osa ohjelmistoista/työkaluista valitaan HUS Acamedicin tilausvaiheessa erikseen, mm. Azure Machine Learning (Azure ML). Azure ML mahdollistaa laskentakapasiteetin varaamisen käyttäjälähtöisesti ja tarjoaa näin Azuren laajan ja skaalautuvan virtuaalikonevalikoiman tutkijoiden käyttöön mahdollistaen vaativatkin tekoälyhankkeet.
Tietoturvallisia käyttöympäristöjä koskeva toisiolain määräys astui voimaan toukokuussa 2022. Sosiaali- ja terveystietoja käytetään ensisijaisessa käyttötarkoituksessa silloin kun niitä käytetään asiakas- ja/tai potilasrekisterin käyttötarkoitusta varten perustellussa käytössä.
Sotedatan ensisijainen ja toissijainen käyttö
Sotedatan ensisijaista käyttöä voi olla esimerkiksi asiakkaan/potilaan tutkiminen, hoitaminen tai sosiaalihuollon asiakkaan vastaanottama palvelu. Kun sotedataa käytetään muussa tarkoituksessa, on kyseessä toissijainen käyttö. Toissijaista käyttöä säätelee Suomessa laki sosiaali- ja terveystietojen toissijaisesta käytöstä.
Toisiolaissa säädetyt toissijaiset käyttötarkoitukset ovat:
- tieteellinen tutkimus
- tilastointi
- kehittämis- ja innovaatiotoiminta
- viranomaisohjaus ja -valvonta
- viranomaisten suunnittelu- ja selvitystehtävä
- opetus
- tietojohtaminen.
(Lähde: STM )
| Tilastollisen analyysin ohjelmat | Tekstinkäsittelyohjelmat ja Office-työkalut | Kuvantamisen työkalut | Genomityökalut | Muut |
|---|---|---|---|---|
Azure ML (valinnainen)
| Microsoft Office Tools
| ITK-SNAP | Samtools | Visual Studio Code |
| Azure Data Studio | Libre Office
| MRIcroGL | Bcftools | R, Rstudio |
| SPSS | LaTex | 3d-Slicer | Vcftools | Python |
| MikTex | Unipro UGENE | Htslib (tabix, bgzip) | GCC | |
| Quarto | FiJi | BasePlayer | Git | |
| IGV | Azure CLI | |||
| BC | Insight (valinnainen) | Azure Storage Explorer | |||
| Azure Data Studio | ||||
| Azure DevOps (valinnainen) | ||||
| OMOP tools Hades ja Atlas |